Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN7P35236 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN7P35236 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN7P35236 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPN7P35236 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN7P35236 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN7P35236 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms