Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD1P33897 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms