Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABRA5P31644 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms