Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLD1P28340 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLD1P28340 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLD1P28340 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLD1P28340 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLD1P28340 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLD1P28340 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLD1P28340 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLD1P28340 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLD1P28340 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms