Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO1P25800 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO1P25800 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO1P25800 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LMO1P25800 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LMO1P25800 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms