Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PVALBP20472 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PVALBP20472 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PVALBP20472 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms