Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPI1P17947 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPI1P17947 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SPI1P17947 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPI1P17947 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPI1P17947 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPI1P17947 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPI1P17947 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPI1P17947 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms