Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41P11171 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41P11171 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41P11171 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41P11171 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41P11171 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41P11171 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41P11171 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41P11171 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41P11171 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41P11171 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41P11171 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41P11171 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41P11171 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms