Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SFTA3P0C7M3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms