Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47B1P0C2W7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47B1P0C2W7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms