Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXB7P09629 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms