Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOL3O95236 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOL3O95236 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL3O95236 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL3O95236 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms