Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBOX1O75936 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBOX1O75936 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms