Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms