Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC22O60826 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms