Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDIL3O43854 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDIL3O43854 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms