Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DENRO43583 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DENRO43583 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DENRO43583 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DENRO43583 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DENRO43583 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DENRO43583 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DENRO43583 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms