Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYP26A1O43174 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms