Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HCG22E2RYF7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HCG22E2RYF7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms