Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRDCB7Z8K6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRDCB7Z8K6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms