Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GGTLC3B5MD39 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGTLC3B5MD39 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms