Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM223BA6NKX1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM223BA6NKX1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms