Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RGPD3A6NKT7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RGPD3A6NKT7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms