Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF6Q9Y4K3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAF6Q9Y4K3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms