Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRRAPQ9Y4A5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRRAPQ9Y4A5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms