Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms