Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
THSD7AQ9UPZ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
THSD7AQ9UPZ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THSD7AQ9UPZ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms