Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI3Q9ULW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI3Q9ULW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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