Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSKSQ9UJT2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSKSQ9UJT2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms