Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA3Q9UI47 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms