Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLIP2Q9UDT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLIP2Q9UDT6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms