Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CC2D2AQ9P2K1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CC2D2AQ9P2K1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms