Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms