Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNKQ9P0W0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNKQ9P0W0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms