Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP5Q9NZZ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP5Q9NZZ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms