Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RDH8Q9NYR8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms