Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMOD3Q9NYL9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD3Q9NYL9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms