Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX43Q9NXZ2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms