Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMP3Q9NV31 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMP3Q9NV31 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms