Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDP1Q9NUW8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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