Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PDS5BQ9NTI5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PDS5BQ9NTI5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms