Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCND1Q9NSA2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCND1Q9NSA2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms