Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIT2Q9NQR4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms