Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms