Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms