Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIF3L1Q9GZT8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms