Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGAP39Q9C0H5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGAP39Q9C0H5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms