Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRCC1Q9C099 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRCC1Q9C099 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRCC1Q9C099 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms