Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNHG12Q9BXW3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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