Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms